Nizam Razak, người sáng tác ra BoBoiBoy, cho biết ý tưởng thay đổi cốt truyện vào năm 2014 khi ông ở Nhật Bản. Ông đã rất ấn tượng với sự đa dạng của các loại Pokémon. Sau đó, ông có ý tưởng để đa dạng hóa các quả cầu. Họ bắt đầu thực hiện bộ phim này sau khi kết thúc series BoBoiBoy vào giữa năm 2016 và thay đổi cốt truyện để hoạt động tích cực hơn khi BoBoiBoy đi vòng quanh thiên hà thay vì chờ đợi những kẻ thù đến Trái Đất. Các thiết lập trong loạt bài này đã được tăng lên một đến hai năm từ loạt BoBoiBoy nhưng cốt truyện vẫn còn cho 7 đến 12 tuổi. Animonsta Studios đã lên kế hoạch để làm BoBoiBoy Galaxy ít nhất là 300 tập, với các bộ phim điện ảnh sẽ được phát hành hai năm một lần.[5]